Ved Skagensbanens åbning den 24. juli 1890 var Napstjert billetsalgssted, og det lille billetsalgshus blev i 1922 udvidet til en "rigtig" stationsbygning. Ved banens ombygning fra smalspor til normalspor i 1924 blev der anlagt et læssespor af hensyn til et nærliggende privat mergelselskab. Mergeltransporterne ophørte efter af et par år, og sidesporet blev fjernet i 1929.
I 1935 blev Napstjert nedrykket til trinbræt, men stationsbygningen blev brugt til ventesal frem til det blev solgt som privat bolig i 1968, hvorefter der blev opsat et simpelt venteskur på perronen. Trinbrættet blev lukket i januar 2005.
Efter massive borgerprotester blev det genåbnet i 2006 med ny perron og venterum.
Stationsbygningens røde mursten er senere malet hvide og det lille varehus fra 1908 er revet ned.
Billede af Napstjert Trinbræt - Trinbræt er nedrevet, men Napstjert Trinbræt har ligget her. Fotograf: Jacob Laursen - Dato: 2022.09.07 08:35:43
Billede af Napstjert Trinbræt - Trinbræt er nedrevet, men Napstjert Trinbræt har ligget her. Fotograf: Jacob Laursen - Dato: 2009.10.31 09:46:57
Billede af Napstjert Trinbræt - Trinbræt er nedrevet, men Napstjert Trinbræt har ligget her ved baneoverskæringen på den anden side af banen. Fotograf: Jacob Laursen - Dato: 2009.10.31 09:46:35
Billede af Napstjert Trinbræt - Trinbræt er nedrevet, men Napstjert Trinbræt har ligget her. Fotograf: Jacob Laursen - Dato: 2009.10.31 09:46:18
Kort over Napstjert Trinbræt [1935-2005] - Kilde: Indeholder data fra Styrelsen for Dataforsyning og Effektivisering, skærmkortet, WMS-tjeneste via datafordeler.dk (Ortofoto forår)
Kort over Napstjert Trinbræt [1935-2005] - Kilde: Indeholder data fra Styrelsen for Dataforsyning og Effektivisering, skærmkortet, WMS-tjeneste via datafordeler.dk (Topgrafisk kort 1980-2001)
Kort over Napstjert Trinbræt [1935-2005] - Kilde: Indeholder data fra Styrelsen for Dataforsyning og Effektivisering, skærmkortet, WMS-tjeneste via datafordeler.dk (Topografisk kort 1953-1976)
Kort over Napstjert Trinbræt [1935-2005] - Kilde: Indeholder data fra Styrelsen for Dataforsyning og Effektivisering, skærmkortet, WMS-tjeneste via datafordeler.dk (Lave Målebordsblade 1901-1971)